科学在文艺复兴以后逐渐从哲学中独立出来。独立意味着科学将原属其母体即哲学的部分知识领地据为己有，这种渊源和发展态势，决定了“科哲”之间的关系难免纠缠和对立。中国学术史上，经典思想家对达道路径所作的“尊德性”与“道问学”的区分，在演化过程中，逐渐获得了类似西方对知识领地进行“科学”与“哲学”分割的学术特征。在晚清的西学东渐中，由“道问学”推延而来的考据学与科学结了缘，而与“尊德性”旨趣相通的理学（或心学）则与哲学挂上了钩。“科哲关系”不仅是“科玄论战”打响的学术背景，也是论辩各方刻意诠释的对象。尽管第一次世界大战带给思想界的震动，使传统的学术话题带上了鲜明的时代色彩，但论战的学术品格和思想特征则依然与“科哲关系”史的影响密不可分。
